在人体的脊柱内，有三条重要的能量通道，分别是Ida（伊达）、Pingala（品格拉）和Sushumna（苏素纳）。Ida（伊达）是思维（负极能量）流动的通道；Pingala（品格拉）是普拉纳（正极能量）流动的通道，哈他瑜伽平衡普拉纳和思维，也即平衡伊达和品格拉。当伊达和品格拉平衡之后，流通昆达理尼（中性能量）的道路Sushumna（苏素纳）就会疏通，脊柱根处的海底轮被激活，位于这个地方的昆达理尼能量就被唤醒，它经过每一个轮向上，最后伊达、品格拉和苏素纳所携带的三种能量在眉心结合，这就是哈他瑜伽。三个能量合而为一，向上到达头顶，和至高的意识结合，这就是瑜伽（或者王瑜伽）。
现代物理学证明，物质可以转变成能量，能量也可以转变成物质。同样地，人体内的普拉纳可以转化成思维，思维可以转化成更高的意识，三者相互关联。我们的身体是神圣的，因此就没有理由贬低自己的肉体，也没有理由不去冥想。在哈他瑜伽中，首先照顾肉体，通过六种方法清洁它，其次练习体位和调息。不管你信不信，一些伟大的圣人想要离开世俗时，就将肉体转变成光粒子，然后完全消失。
哈他瑜伽体系从体位姿势开始练习，这一点与 传统的“八分支法”不同，因此也被称为“六分支法瑜伽”。哈他瑜伽主要练习如何控制身体和呼吸，更深一层的效果是使身体各机能有序运转，从而使心灵获得宁静，变得祥和。目前，国内的哈他瑜伽主要以 姿势和呼吸的练习为主，以冥想与收束法为辅。大部分瑜伽馆教授的都是这个体系。
真正的哈他瑜伽练习能量，最后实现意识的转化和提升，因此必须严格遵守规则，做好牺牲的准备，要放弃那些对习练不利的事情。就目前国内的哈他瑜伽市场而言，看到的只是热火朝天的市场，哈他瑜伽难以实现。原因之一是真正的哈他瑜伽练习十分艰难，需要修炼得道的师傅的引领，需要抛弃现有的舒服生活，需要花费几乎一辈子的时间。我认识的几位印度和中国瑜伽老师是有真正功夫的，也相信还有一些我不认识的哈他瑜伽大师，但不得不说大部分都是花拳绣腿，徒有其名。
